La DNA polimerasi III batterica è un enzima molto complesso che coadiuva, nei procarioti, la duplicazione del DNA. Un nome alternativo della DNA polimerasi III procariotica è oloenzima. Questo termine indica che l'enzima è composto da molte subunità che svolgono differenti ruoli.
Il core della polimerasi è la parte più importante ed è formata da tre subunità α, ε e θ. La subunità α possiede attività polimerasica mentre ε possiede una attività esonucleasica 3'→5'. Allo stesso modo della DNA polimerasi I procariotica, se l'enzima inserisse un nucleotide sbagliato la funzionalità esonucleasica “a ritroso” permetterebbe di sbloccare l'oloenzima e di correggere l'errore. In aggiunta, un dimero β costituisce la cosiddetta pinza dell'enzima che ha il compito di legare saldamente il DNA.
Struttura della DNA polimerasi III procariotica.
Pinza scorrevole
La parte più importante della DNA polimerasi III è rappresentata dalla cosiddetta pinza scorrevole che è formata da un dimero di due subunità β. Questa struttura aggancia il DNA avvolgendolo saldamente; il lume che si forma è pari a circa 90Å, circa il doppio della dimensione del DNA, e interagisce con il doppio filamento anche grazie alla presenza di molecole di acqua. La pinza è estremamente stabile e non permette la “fuoriuscita” del DNA; per questo motivo esiste un complesso eteromerico, formato in genere da due o tre subunità uguali definite γ, che provvede al montaggio della pinza.
L'elicasi, il cui nome alternativo è quello di DNAB, procede, come abbiamo già avuto modo di vedere, all'apertura della doppia elica.
Introduzione all'informazione genetica:
DNA e
RNA,
cromosoma,
cromatina,
genoma.
Trascrizione:
RNA polimerasi batterica,
allungamento dell'RNA,
Trascrizione eucariotica,
terminazione della trascrizione,
RNA interference (
pre-mRNA,
siRNA).
Traduzione:
Ribosoma,
RNA ribosomiale,
ribozima,
trascrittoma.
Duplicazione del DNA:
Primosoma,
forcella di replicazione,
DNA polimerasi I procariotica,
DNA polimerasi III procariotica,
Terminazione della duplicazione del DNA.
Tecniche e laboratorio PCR,
LCR,
Real time PCR.
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